בארבע עשרה בנובמבר 2013 פתחנו בבית הספר לשלום קורס מנחים לקבוצות בקונפליקט.
הקורס כולל 120 שעות ומורכב משלושה חלקים: חלק התנסותי, חלק תאורטי ולמידת מיומנויות הנחייה. החלק התאורטי ניתן על ידי מרצים אורחים וכולל הרצאות על: משנתו של פאולו פרירה, שיטת העבודה שפיתח ביה"ס לשלום ומיקומה בגישות שונות להנחיית קבוצות בקונפליקט, השפה במפגש היהודי-ערבי, מלחמת 48 הנקבה מנקודת מבט היסטורית פלסטינית, תאוריות פוסט קולוניאליסטיות, הלא מודע החברתי בהנחיית קבוצות ומשנתו של ביון, ניהול ועבודה משותפת באירגונים יהודיים ערביים, תאוריות של זהות חברתית ותאוריות התפתחותיות של זהות. מיומנויות ההנחיה נלמדות באמצעות הנחיית עמיתים. המשתתפים מנחים את הקבוצה ולאחר מכן מנחי הקורס מנתחים את התהליכים ונותנים משוב להנחיה. החלק השלישי כולל תצפית מודרכת בסדנת נוער. השנה הקבוצה מונה 15משתתפים 9 יהודים ו6 ערבים. מרבית המשתתפים השנה מגיעים מארגונים לשינוי חברתי ואירגונים העוסקים בקונפליקט היהודי ערבי כמו אג'יק, עמק שווה, זוכרות, פסיכו אקטיב, קול אחד, מג"ל. חלק מהמשתתפים מעוניינים להיכנס לתחום של הנחיית מפגשים בין יהודים וערבים וללמוד את שיטת ההנחיה הבין קבוצתית שפיתחנו בבית הספר לשלום. עד כה הכשיר ביה"ס לשלום כ1000 מנחי קבוצות בקונפליקט שרבים מהם מובילים היום ארגוני שלום וארגוני זכויות אדם.